产品和服务

安诺基因

公司建立了包含PromethION、PacBio Sequel、NovaSeq 6000、HiSeq X等

新一代测序仪的高通量测序平台,并与Illumina联合开发了

新一代桌面测序仪NextSeq 550AR,可以对DNA、RNA等不

同分子类型的样本进行测序分析,具备检测大批量样本的能力。

新闻中心
开讲啦!单细胞ATAC-seq分析流程轻松get~

在高通量测序技术日新月异的今日,更多科研人员的研究关注点聚焦在单细胞水平上,大规模单细胞测序平台(点击链接获取更多内容)的商业研发推动了细胞图谱的绘制、细胞动态变化的研究。目前,10x Genomics单细胞平台凭借自身技术优势和成熟商业化逐步受到广大科研人员的青睐。


近年来,利用各种测序技术进行表观遗传学的研究一直很火热,除了DNA甲基化等研究表观修饰的技术外,研究染色质开放性相关的技术也不断受到追捧。ATAC-seq在染色质开放性检测技术中,具有操作简单、省时省力、无需抗体富集、样本起始量低等显著优势。


近期10x Genomics推出了单细胞ATAC测序技术,该技术和BulkATAC-seq的区别是什么?如何将该技术与研究的课题进行结合?利用该技术能得到什么结果,达到怎样的研究目的?本周安诺基因的生信在线交流将为您一一解答,欢迎有兴趣的老师加入在线交流群(诺基因生物信息交流QQ群:475638865),与我们一起讨论,共同进步~



10x Genomics单细胞ATAC序技术在线交流


交流主题

10x Genomics单细胞ATAC测序技术及分析流程介绍

交流内容

单细胞ATAC技术介绍;

单细胞ATAC分析流程;

单细胞ATAC实测数据解读……

(以上并非全部分享内容,获取更多干货请参与当日交流分享。)

交流时间

2019年3月28日,15:00-16:00

交流平台

安诺基因生物信息交流QQ群,同步交流:1群(213357902),2群(475638865)(1群已满,新加入的老师请加2群。)

注:新进群的老师请务必备注姓名及工作单位。 

交流形式

视频/语音实时交流

主持人

单细胞产品经理

主讲人

高级信息分析工程师


您可以在评论里留下您感兴趣的问题,我们将对问题进行整理,在线交流的过程中主讲人和信息分析负责人将为您详细解答。



10x Genomics单细胞多组学


从2016年10x Genomics单细胞转录组首篇Cell文章见刊至今,利用10x Genomics平台开展研究的热潮持续升温,目前已覆盖基因组、转录组、表观组这三大组学。单细胞转录组发表文章数破百,称霸CNS各大顶级期刊,前面几期小编为大家介绍了单细胞转录组在肿瘤(点击链接获取更多内容)分化再生神经领域的研究应用,针对免疫细胞也有个性化的VDJ产品,在现有最全的单细胞转录组解决方案基础上,单细胞ATAC-seq也已加入10x单细胞平台,不仅可从转录组层面研究基因表达,也可从表观层面研究基因调控。



图 安诺单细胞测序技术总览

图 安诺单细胞测序技术总览


作为国内单细胞测序技术整体解决方案的提供商,目前安诺基因单细胞多组学研究具有全面的产品,覆盖三大组学(基因组、转录组、表观组),拥有丰富的项目经验、合作单位100+物种经验50+、多篇高分文章IF累计100+,能够有针对性并准确服务于不同的研究领域及研究策略,使得科研工作者可以更深入地了解细胞间的异质性。




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Hi-C又出新品?无需多组学,肿瘤研究新突破

世界上没有两片完全相同的树叶,也没有两个完全相同的肿瘤细胞。

大数据时代,我们很容易找到每个肿瘤样本中成千上万的突变,

但我们对肿瘤致病机理的认识却九牛一毛。

发现,每一个肿瘤样本的独特结构,

打开,你不曾触及的染色质构象视角。



安诺肿瘤Hi-C,一个为肿瘤样本染色质构象研究量身定制的一站式平台,他的闪光点,你值得期待~



低至一万个细胞建库,珍稀样本的建库福音



一直以来,近千万个级别细胞的Hi-C文库构建标准,极大限制了肿瘤研究领域微量样本的染色质构象解析及深入的研究探索。安诺肿瘤Hi-C,成功突破了样本量“高不可攀”的建库门槛,专业解决珍稀样本的Hi-C建库问题。


1)样本要求

悬浮细胞、贴壁细胞、新鲜组织


2)样本个数

 ≥2个,实验组、对照组


3)样本量需求(单个文库)

常规:5×106个细胞/100 mg新鲜组织;

低样本量:1×104个细胞/10 mg新鲜组织。


4)样本前处理

新鲜样本甲醛固定后,-80℃冻存,干冰冷冻运输。



无需多组学,染色体易位分析一网打尽



癌症中基因组重排事件不仅能改变染色体一维结构,也会改变相关基因区域的三维空间结构。肿瘤Hi-C,无需多组学,一套Hi-C数据,实现染色体间易位事件(Inter-Translocation)检测和所有染色体间互作信号的热图展示。


图1 染色体间易位分析

图1 染色体间易位分析



构象差异分析,肿瘤样本专属套餐


1)IDE模块—顺反式互作强弱多方位比较

染色质相互作用强度随距离衰减,IDE分析可从多角度解析肿瘤样本染色质顺势互作强度的变化。


图2 IDE模块结果展示

图2 IDE模块结果展示


 

2)Delta_HiC 模块差减分析,让差异可视化结果更清晰

癌症细胞系相对于正常样本来说,基因组重排事件的发生对染色体位点间的互作有着重要影响。Delta_HiC分析通过样本间的互作矩阵差减,解析肿瘤样本的特异性互作。


图3 样本间不同位点互作的差异构象

图3 样本间不同位点互作的差异构象



3)TAD 模块挖掘肿瘤样本特异TAD结构

TAD边界滑动分析,不放过肿瘤样本中每一个新形成的TAD边界和消失的TAD边界。特定区域TAD可视化,想分析哪里就展示哪里。


图4 TAD分析结果展示

图4 TAD分析结果展示



4)A/B Compartment 模块肿瘤样本A/B组分差异可视化

多种形式展示A/B组分差异,发现肿瘤样本A/B组分变化情况,统计分析或图片展示,多种结果形式任意选择。


图5 A/B Compartment 模块结果展示

图5 A/B Compartment 模块结果展示  


 

新品促销,价格优惠



即日起至2019年4月30日,签单肿瘤Hi-C产品,包含建库测序分析全套服务内容,统一8.5折!您要的性价比,只高不低~ 感兴趣的小伙伴们赶紧联系我们吧!



安诺基因作为业内三维基因组测序技术的服务供应商,自2015年初,首次在国内推出动物群体Hi-C和单细胞Hi-C测序服务,随后将人类染色体三维构象解析的分辨率提升至1kb水平,同年12月在国内首次推出植物Hi-C测序服务。四年来,安诺Hi-C技术不断发展,众多研究者利用安诺Hi-C技术取得了丰硕的成果。作为国内三维基因组测序技术的服务提供商,安诺基因与法国居里研究所、中国农业大学、中科院动物所、西南大学、南京医科大学等多家科研院所深度合作,相关研究成果已发表在NatureGenome BiologyNature communicationsMolecular Plant等国际高水平期刊,累计IF高达109.5,平均IF12.16



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表观遗传学与前沿基因组学技术研讨会一轮通知

Nature杂志评选出2019年需关注的7大技术中包括时下火热的单细胞测序技术和三维基因组学成像技术。单细胞测序技术能解决因细胞异质性所带来的样本真实性问题,从单细胞层面挖掘更丰富的遗传信息,在生殖发育、肿瘤、神经科学、免疫学和微生物研究等领域具有广泛的应用前景;而三维基因组学重点关注空间构象与基因转录调控间的关系,为基因组的折叠和空间构象、转录调控机制、信号传导通路和基因组的运行机制等重要问题提供深入探讨和研究依据。


为聚焦医学和生物学领域的前沿研究动态,推动基础科研和转化研究,安诺优达生命科学研究院联合上海交通大学于2019年5月17日共同举办“表观遗传学与前沿基因组学技术研讨会”。本次会议以“单细胞和三维基因组学技术”为探讨对象,拟邀多位院士、专家、科研工作者等,通过专题分享、圆桌讨论等多种交流形式分享两大技术在相关研究领域的最新前沿动态、研究成果等。


一、会议基本信息

1) 会议时间:2019年5月17日

2) 会议主办方:安诺优达生命科学研究院、上海交通大学医学院

3) 会议协办方:安诺优达基因科技(北京)有限公司

4) 会议地点:上海交通大学医学院

5) 会议规模:200人


二、会议主题

1) 单细胞研究前沿技术进展

2) 单细胞水平的干细胞研究

3) 单细胞水平的生殖发育研究

4) 单细胞水平的肿瘤研究

5) 三维基因组学技术在肿瘤等医学研究领域的应用

6) 三维基因组结构与调控研究

7) 三维基因组学信息分析及应用


三、参会嘉宾


参会嘉宾.png


嘉宾持续更新中。。。。。敬请期待


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安诺科服产品全线升级,优惠巨献

俗语说:一日之计在于晨,一年之计在于春。初春三月,安诺基因重磅出击,科技服务产品线全线升级,DNA、RNA、外显子产品周期大提速,特色产品Hi-C、单细胞10x Genomic、三代人基因组产品分析内容全新升级。安诺基因将在产品升级的基础上,答谢广大客户,优惠巨献。



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01 7天DNA快速建库测序,满5T,免费赠SNP/InDel Calling分析!

02 12天真核mRNA-seq签单满10万,9折再送个性化分析

03 12天Agilent V6极速外显子组签单满10万,免费赠CNV检测


以上产品除上述优惠外还可选每满10例样本,免费赠1例样本!限时优惠二选一!


特色领先产品


01 10x Genomics单细胞转录组4个样本以上每个直降3000元,8个样本以上免费送高级分析!

02 肿瘤Hi-C和ATAC-seq新品促销,建库测序分析打包价8.5折特惠!

03 三代人重测序,10X以上数据,每个样本直降3000元



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活动时间:即日起-2019年4月30日

 

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