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开年尝鲜|MAS Bulk Iso-seq技术「龍」重登场
发布时间:2024-01-17

三代测序技术在获取全长mRNA序列方面有着突出贡献,但在准确定量和发现新的RNA同源异构体方面仍然存在局限性。近期PacBio推出Kinnex全长RNA测序试剂盒,将MAS-seq技术扩展至Bulk RNA测序应用,我们称之为MAS Bulk Iso-seq技术。该技术可将 cDNA 串联成优质的单分子长片段,无需打断拼接,实现Revio平台对完整全长转录本的测序。


表1 二代和三代转录组测序内容对比

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目前,PacBio官方已公开了采用人(HG002)和UHRR样本,基于MAS-seq建库+Revio平台 HiFi测序技术的Bulk RNA测序数据。绘制饱和曲度线,展示在不同测序深度下基因和isoforms的检出数据(图1),发现在不同的测序深度下数据表现不同(表2),适当提升测序深度有助于增加低/中丰度转录本和复杂异构体的检出率,并在一定测序深度下实现转录本整体定量,不再需要依赖二代测序技术定量和测序纠错。


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图1 HG002和UHRR样品的genes和isofroms饱和度曲线


为了助力更多学者的科学研究,安诺优达正式上线MAS Bulk Iso-seq技术,针对不同物种和不同科研需求,结合物种转录本复杂程度,我们为您推荐不同的测序数据量:动植物全基因组注释推荐5M reads,肿瘤疾病研究推荐10M reads,竭诚为您服务。


表2 人(HG002)和UHRR样本Revio测序数据表现


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安诺优达MAS Bulk Iso-seq产品限时尝鲜活动已火热开启,有效期至2024年3月31日。有意向的客户可扫码登记或联系驻地销售咨询相关事宜,也可发送邮件至TS_Support@genome.cn,我们将在24h内为您答疑~


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*该活动最终解释权归安诺优达所有。