新闻中心

Revio协同Kinnex全长转录组,产能炸街
发布时间:2024-04-25

Kinnex全长转录组基于PacBio Revio测序仪生成的全长HiFi reads,解决了二代数据拼接难、拼接不准确等难题,使研究者能够以全新水平的信息密度和发现潜力研究三代转录组数据。


Kinnex 全长RNA试剂盒采用MAS-seq方法来提高 Revio测序仪的通量,该方法可将小片段的cDNA分子串联成可直接用于HiFi测序的单分子长片段。与典型的Iso-seq文库相比,Kinnex文库通量提高了8倍;与Sequel II系统相比,Revio测序通量提升了近15倍(图1)。双层buff加持,顺利推进全长转录组测序研究进入了高通量低成本时代,为大规模人类基因组学和农业基因组学的研究带来了新机遇。


1_副本.png

图1 Revio Kinnex产出与Sequel II对比(左:PB官方数据;右:安诺优达实测数据)


安诺实测数据展示


01 Revio Cell产出数据展示


自安诺优达推出Kinnex 全长转录组后,陆续有客户闻声而来,现已积累了人、拟南芥、大豆、玉米、甘蔗、烟草、松鼠、玉米等多种物种/项目经验。


图2实测结果显示,Kinnex数据具有优质的数据产出和良好的数据稳定性。3月末PB官方更新Kinnex上机流程后,安诺优达及时试测,借助积累的建库技术经验,Kinnex全长转录组产能实现飞跃性突破。


安诺优达Cell产出张张喜人,单Cell高产达6.3 M HiFi reads,48.3 M reads转录本;平均达4.7 M HiFi reads,35.4 M reads转录本,优化流程后单cell平均达5.9 M HiFi reads,44.9 M reads转录本,平均质量值可达Q33。


2.png

图2 安诺部分Kinnex实测数据展示


02 人源样本数据展示


6例人样本混样包Cell测序,Cell产出5.5M HiFi Reads,81.1Gb,拆分转录本为41.6 M Reads,HiFi Reads N50平均长度达18.90 Kb。相对于传统Sequel II全长RNA单Cell 2-4 M HiFi Reads,Kinnex-Revio有效数据量提升了10倍以上。


拆分后单样本实际产出均大于需求产出5M HiFi Reads,平均质量值达Q33。


表1 人样本数据产出情况

3_副本.png

4_副本.png

图3 HiFi Reads长度和reads数量分布图


针对不同物种和不同科研需求,结合物种转录本复杂程度,安诺优达将量身推荐测序数据量,全方位助力科研!


未命名_副本.jpg


限时活动


安诺优达Kinnex全长RNA测序技术尝鲜活动火热进行中,有效期至2024年6月30日,欢迎大家咨询,送样。详询驻地销售,或发送邮件至TS_Support@genome.cn邮箱,我们将在24h内为您答疑~