《“十四五”推进农业农村现代化规划》提出要加快实施农业生物育种重大科技项目，有序推进生物育种产业化应用！这不仅强调了生物科技与信息、智能等数字技术的深度融合，还让我们看到了农业现代化的未来趋势！划重点，国自然基金申请中关于“数据库构建”的经费越来越多了！基因大数据时代，专属于每一个物种的数据库，可以为科研与育种工作提供丰富的数字化资源！
物种数据库对于发paper重要嘛？小编整理了关于利用组学数据开展生物信息分析和搭建数据库平台的高分文章，真的是层出不穷！下面给大家分享两个组学和数据库背靠背发表高分文章的案例。
水稻泛基因组与数据库
华中农业大学联合多个国内外高校与科研机构在Nature Communications（IF=16.6）与Molecular Plant（IF=27.5）期刊连续发表两篇研究论文，以代表亚洲稻群体结构的高质量基因组为研究对象，构建并分析基因组倒位图谱，建成基于同源基因簇的水稻泛基因组综合数据库-Rice Gene Index (RGI)。
该研究利用16个亚洲栽培稻亚群代表性种质高质量基因组、57个筛选后的公开基因组以及2个新组装的野生近缘种高质量基因组构建亚洲栽培稻泛基因组倒位图谱，探讨了亚洲水稻的亚种群结构和演化，通过构建全基因组倒位图谱来进一步估计亚洲稻中倒位频率，倒位变异对基因表达、重组率和连锁不平衡的影响，揭示了亚洲水稻泛基因组中倒位变异的普遍性[1]。
该研究通过整合和利用亚洲栽培稻代表性种质的基因组信息，进行综合比较分析，建立了基于同源基因簇的泛基因组数据库Rice Gene Index（RGI, https://riceome.hzau.edu.cn/），为全球水稻研究人员提供免费在线检索和分析服务[2]。
狼尾草泛基因组与数据库
四川农业大学联合国内外多家机构在Nature Genetics（IF=30.8）和Plant Biotechnology Journal（IF=13.8）期刊上先后发表两篇学术论文，以狼尾草高质量基因组为研究对象，构建了美洲狼尾草图形泛基因组，建成了一个详实、系统的millets多组学数据分析平台。
该研究组装了适应全球不同气候的10个美洲狼尾草代表性种质的高质量染色体序列，构建了图形泛基因组图谱，共鉴定了424,085个结构变异，并揭示了结构变异对其优良耐热性的贡献。整合了多组学分析并辅以基因功能验证，发现RWP-RK类转录因子家族的扩张和SV参与调控内质网系统基因的表达改变，共同促进了美洲狼尾草优异耐热性状的形成[3]。
该研究数据库涉及millets一类及其相关物种的18个基因组、美洲狼尾草图形泛基因组、抗逆相关的多组学数据和20个产量性状相关的GWAS数据等[4]。
其他数据库高分文章展示
育种研究中，数据库将是必然趋势，是一场新的科研风潮。搭建一个数据库平台，不仅方便整理相关数据，还能促进学术交流共享，碰撞出更多科研“火花”。安诺优达可承接基因组标准数据库、多组学数据库以及定制化数据库搭建服务，让你拥有丰富的信息资源和分析工具，助力生物学基础研究。如您有数据库相关意向，请联系安诺当地销售，可以根据您的研究目的，为您提供数据库搭建服务~
参考文献：
[1]Zhou Y, Yu Z, Chebotarov D, et al. Pan-genome inversion index reveals evolutionary insights into the subpopulation structure of Asian rice. Nat Commun. 2023;14(1):1567.
[2]Yu Z, Chen Y, Zhou Y, et al. Rice Gene Index: A comprehensive pan-genome database for comparative and functional genomics of Asian rice. Mol Plant. 2023;16(5):798-801.
[3]Yan H, Sun M, Zhang Z, et al. Pangenomic analysis identifies structural variation associated with heat tolerance in pearl millet. Nat Genet. 2023;55(3):507-518.
[4]Sun M, Yan H, Zhang A, et al. Milletdb: a multi-omics database to accelerate the research of functional genomics and molecular breeding of millets. Plant Biotechnol J. 2023;21(11):2348-2357.
[5]Yang Z, Luo C, Pei X, et al. SoyMD: a platform combining multi-omics data with various tools for soybean research and breeding. Nucleic Acids Res. 2024;52(D1):D1639-D1650.
[6]He Q, Wang C, He Q, et al.A complete reference genome assembly for foxtail millet and Setaria-db, a comprehensive database for Setaria. Mol Plant. published online December 28, 2023.
[7]Zhu Y, Wang Z, Zhou Z, et al. HEMU: An integrated comparative genomics database and analysis platform for Andropogoneae grasses. Plant Commun. 2023.
[8]Lu K, Pan Y, Shen J, et al. SilkMeta: a comprehensive platform for sharing and exploiting pan-genomic and multi-omic silkworm data. Nucleic Acids Res. 2024;52(D1):D1024-D1032.
[9]Yang S, Zong W, Shi L, et al. PPGR: a comprehensive perennial plant genomes and regulation database. Nucleic Acids Res. 2024;52(D1):D1588-D1596.
[10]Ranawaka B, An J, Lorenc MT, et al. A multi-omic Nicotiana benthamiana resource for fundamental research and biotechnology. Nat Plants. 2023;9(9):1558-1571.
[11]Gao Y, Zhang C, Yuan L, et al. PGG.Han: the Han Chinese genome database and analysis platform. Nucleic Acids Res. 2020;48(D1):D971-D976.