全基因组重测序是指对基因组序列已知物种的个体或群体进行基因组测序，并以此为基础进行个体或群体水平的遗传差异分析，其为动植物育种研究提供了一个快速有效的方法。基于全基因组重测序，促使研究人员快速推动育种进程，主要包括以下几个方面，接下来就让小编带大家了解一下吧~
01 寻找大量遗传变异
安诺产品：二代/三代全基因组重测序变异检测
利用全基因组重测序技术对某一物种个体或群体的基因组进行测序及差异分析，获得SNP、InDel、SV、CNV等大量的遗传多态性信息，建立遗传多态性数据库，为后续揭示进化关系、性状候选基因的挖掘等奠定基础。
变异类型
02 核心种质资源筛选
安诺产品：二代全基因组重测序变异检测
核心种质资源最大限度地保存了整个资源群体的遗传多样性，同时代表了整个群体的地理分布，对核心种质进行重测序，可以深入了解其基因与基因型最大范围的遗传多样性，辅助建立种质资源库，还有利于促进种质交流、利用和管理，针对性地进行品种保护，也可以为品种分子改良提供优良基因等。
高粱种质遗传多样性（Girma et al., 2020）
03 遗传进化分析
安诺产品：群体进化
针对已有参考基因组的物种，对其各亚种进行全基因组重测序获得基因组信息，通过与参考基因组比对，得到大量高准确性的SNP、InDel、CNV、SV等变异信息，讨论群体的遗传结构、驯化机制、种群历史以及群体进化动态等生物学问题，在分子层面揭示该物种的进化机制、环境适应性等系列问题。主要包括几个方面：
① 收集可能为起源地的所有群体材料，解析物种起源、迁移路线及进化关系；
② 收集野生型和不同地区的驯化型材料，分析物种人工驯化机制及受选择基因；
③ 收集地方种和不同地域不同时期的育成种，研究物种改良机制及改良基因；
④ 收集不同地理分布、不同海拔高度分布的群体材料，解析物种适应性进化机制及受选择基因；
⑤ 收集不同家系的物种群体材料，开发不同家系分子标记并划分家系。
核桃群体结构与系统发育分析(Ding et al., 2022)
04 性状候选基因预测
安诺产品：全基因组关联分析
对已有参考基因组的某一物种群体进行全基因组重测序，检测分布于全基因组范围内的SNP标记，基于它们与分析性状的连锁不平衡关系，通过各种统计分析方法，获得与这些性状关联的候选基因或基因组区域。
小麦株高性状位点鉴定（Li et al., 2022）
今天的分享就到此结束了，相信您收获收满满，有任何测序分析方面的需求可以联系我们驻地销售同事，安诺优达将竭诚为您服务！
参考文献：
[1] Girma G, Nida H, Tirfessa A, et al. A comprehensive phenotypic and genomic characterization of Ethiopian sorghum germplasm defines core collection and reveals rich genetic potential in adaptive traits. Plant Genome. 2020;13(3):e20055.
[2] Ding YM, Cao Y, Zhang WP, et al. Population-genomic analyses reveal bottlenecks and asymmetric introgression from Persian into iron walnut during domestication. Genome Biol. 2022;23(1):145.
[3] Li A, Hao C, Wang Z, et al. Wheat breeding history reveals synergistic selection of pleiotropic genomic sites for plant architecture and grain yield.Mol Plant. 2022;15(3):504-519.