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微生物群落多样性分析

  • 技术简介


    微生物群落多样性分析是利用二代高通量测序技术,对微生物的16S rDNA、18S rDNA以及ITS高变区域,分析环境中细菌、古细菌以及真菌的种类组成和结构,揭示环境样品中微生物种类以及它们之间的相对丰度、进化关系,进一步探讨微生物多样性;该技术对于研究微生物与人类医疗健康、食品安全、环境检测与治理、微生物资源的利用等有着重要的应用意义。


    16S rDNA测序:16S rDNA为编码原核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列,采用HiSeq或最新的MiSeq测序仪,对16S rDNA某个高变区进行测序,通过生物信息分析环境微生物中细菌或古细菌的多样性。


    18S rDNA测序:18S rDNA为编码真核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列。在结构上分为保守区和高变区,保守区反映生物物种间的亲缘关系,高变区反映物种间的差异。


    ITS测序:ITS分为两个区域:ITS1/ITS2,其中ITS1位于真核生物核糖体rDNA序列18S和5.8S之间,ITS2位于真核生物核糖体rDNA序列5.8S和28S之间。对ITS1或者ITS2进行测序,通过生物信息分析环境微生物中真菌多样性分析。


    优势


    微生物群落多样性分析优势

    应用领域


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