重磅!仅需1万个细胞,安诺Hi-C建库再降门槛
2019.03.08

2018年底,安诺基因成功推出了10万个细胞水平的Hi-C建库,率先实现了低起始量Hi-C建库的产业化服务。仅仅2个月,2019年刚刚开启,安诺研发再传捷报,1万个细胞Hi-C建库成功交付!小编不禁感叹,地球不爆炸,研发不下架,宇宙不重启,研发不停息~ 安诺Hi-C没有四季,专注提升硬实力,天天都是奋斗季~



快来看看安诺1万个细胞建库的数据质量吧~



样本要求



样本类型:细胞(人、鼠或其他物种)

建库起始量:1万个交联细胞样本/文库

测序平台:Illumina HiSeq X Ten,PE150



文库质控



我们对10多例人和小鼠的细胞样本进行了稳定性测试,评估结果显示,最终可用于分析的Valid Rate(%)均在55%以上,最高可达82%,有效数据比例依旧杠杠滴~ 部分样本文库质控结果如下(小数据测试结果):



部分样本文库质控结果



cis/trans interaction比例统计



判断Hi-C文库是否合格的一个重要指标是cis/trans比值,cis指的是paired reads在同一条染色体上(intra-chromosomal interactions),trans指的是paired reads在不同染色体上(inter-chromosomal interactions)。一般认为cis interaction比例越高,表明该数据的质量越好。我们的统计结果显示,测试样本cis rate(%)均在80%以上,数据质量良好。



cis/trans interaction比例统计



交互热图结果展示



对小数据结果进行交互热图分析,如下图所示,展示了genome-wide Hi-C交互热图。


交互热图结果展示




相比于10万个细胞的建库水平,1万个细胞Hi-C建库的成功研发让更多生殖和肿瘤等研究领域的微量样本染色质构象解析成为可能,极大拓展了Hi-C这项前沿技术的应用范围和使用人群,也为更多的科研工作者攻克生命科学领域的未解难题提供了新思路



 Tips:1万个细胞建库远不是我们的终点,安诺Hi-C研发团队一直致力于解决珍稀样本的建库问题,让我们相约下一个突破性进展吧~



安诺基因作为业内三维基因组测序技术的引领者,自2015年初,首次在国内推出动物群体Hi-C和单细胞Hi-C测序服务,随后将人类染色体三维构象解析的分辨率提升至1kb水平,同年12月在国内首次推出植物Hi-C测序服务。四年来,安诺Hi-C技术不断发展,众多研究者利用安诺Hi-C技术取得了丰硕的成果。作为国内三维基因组测序技术的服务提供商,安诺基因与法国居里研究所、中国农业大学、中科院动物所、西南大学、南京医科大学等多家科研院所深度合作,相关研究成果已发表在NatureMolecular PlantNature communicationsGenome Biology等国际高水平期刊,累计IF109.5,平均IF 12.16



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